1958年夏，中共泰县县委决定筹建“泰县农业中等技术学校”（学院前身），招收农作物、畜牧兽医专业学生各50名（三年制）。 

1959年1月，因泰州市、泰县合并为泰州县，故泰县农校、泰州市农业专科学校二校合并为“泰州市农业专科学校”。 

1959年，学校定名为“江苏省泰州农业学校”。 

1961年，扬州专署发文将“江苏省泰州农业学校”改名为“江苏省泰州畜牧兽医学校”，隶属扬州专署领导。 

1962年1月，学校搬到泰县白马庙泰州师范校园内（现白马老校区）。 

1962年6月17日，江苏省人委下达全省学校停办的指令，学校停办。 

1965年7月，学校恢复办学。

1978年，学校恢复招生。 

1979年，扬州地委发文恢复“江苏省泰州畜牧兽医学校”校名，隶属扬州地区行署领导。 

1992年，学校将教学区由白马庙迁入泰州市文教区（泰州宾馆东侧，现迎宾路校区）。

1995年4月，省政府于批复同意该校改名为“江苏省畜牧兽医学校”。

2001年6月，江苏畜牧兽医职业技术学院在江苏省畜牧兽医学校基础上建立。

2005年11月，学院凤凰路校区一期工程破土动工。

2005年，学院通过江苏省高职高专人才培养工作水平评估，取得优秀等级。

2008年，学校被评为江苏省示范性高等职业院校建设单位。

2010年，学院成功申报国家示范性（骨干）高等职业院校。 

2013年3月31日，经江苏省政府批准同意，江苏畜牧兽医职业技术学院正式更名为江苏农牧科技职业学院。

师资力量

据2020年6月学校官网显示，学校有专任教师611人，其中高级职称教师229人，教授61人（二级教授5人、三级教授6人），专任教师中硕士学位教师占比72.6%、“双师”素质教师占85.4%。获黄炎培职业教育奖杰出校长奖1人\省水禽产业体系首席科学家1人和岗位科学家1人、省有突出贡献的中青年专家3人、省“六大人才高峰”培养对象9人，省“333高层次人才”第二层次1名、第三层次22人，江苏省高层次创新创业人才培养对象2人、江苏省高校“青蓝工程”培养对象36人、全国农业职教名师9人、江苏省教学名师1人、泰州市“311高层次人才工程”培养对象61人、泰州市有突出贡献的中青年专家6人，省级科技创新团队12个，省级优秀教学团队2个。

江苏畜牧兽医职业技术学院毕业证编号（电子注册号） 编号规则98年前编号编写没有规则 ，2000-2002年为17位，2003年以后为18位。
 前5位 （学校代码）.6位为办学类型代码 普通高等教育为1； 博士为2；硕士为3；学士为4；成人高等教育为5；高等教育自学考试(如自学考试编号：6开头)和高等教育学历文凭考试为6；网络教育为7。7-10位：为颁证年份. 11-12位：为培养层次代码：博士研究生01；硕士研究生02；学士学位04；本科05；专科（含高职）06 ,13-17或18位：为学校对毕业证书的流水编号。