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| 系（部、院） | 专业名称 | 类别 |
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护理系
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护理专业、护理专业（英语方向）和助产专业 |
专科
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| 临床医学系 | 临床医学和口腔医学 | 专科 |
| 中医系 | 中医学 | 本、专 |
| 药学系 | 药学、中药、药品经营与管理、药物制剂技术 | 专科 |
| 针灸骨伤系 | 针灸推拿、中医骨伤、康复治疗技术 | 专科 |
| 医学技术系 | 医学影像技术、医学检验技术、眼视光技术 | 专科 |
| 继续教育学院 | 临床医学、护理、医学影像、医学检验、医学麻醉、口腔医学、眼视光技术、药学、中药、针灸推拿、中医骨伤、中医学和中西医结合 | 成人“专升本”（联合办学）、专科 |
| 国际教育学院 | 南阳医专与菲律宾伊密里欧学院护理、药学、医学影像技术（2011年）、与美国卡姆登学院口腔、医学检验技术（2013年）、与美国卡姆登学院新增临床医学专业（2015年） | 专科 |
| 卫生管理系 | 卫生信息管理、计算机应用技术 | 专科 |
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政治理论教学部
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基础医学部
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| 公共教学部 | --- | --- |
| 体育教学部 |
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