1953年，内蒙古蒙文专科学校成立。

1955年，呼和浩特第二师范学校和内蒙古蒙文专科学校合署办公。

1955年，呼和浩特第二师范学校创建。

1957年，内蒙古蒙文专科学校和呼和浩特第二师范学校分校办学。

1958年，内蒙古蒙文专科学校（中专部，原呼和浩特第二师范学校）改建为呼和浩特第二师范学校。

1960年，呼和浩特第二师范学校更名为内蒙古教师进修学校。

1961年，内蒙古蒙文专科学校和内蒙古教师进修学校合并，仍称内蒙古蒙文专科学校。

1962年，内蒙古教师进修学校并入内蒙古蒙文专科学校。

1981年，内蒙古蒙文专科学校（中专部，原内蒙古教师进修学校）改建为内蒙古民族师范学校。

1981年，根据自治区人民政府决定，内蒙古蒙文专科学校和内蒙古教师进修学校再次分立，师范类专业独立建校，称内蒙古民族师范学校。

2000年，经国家教育部和自治区人民政府批准，内蒙古蒙文专科学校、内蒙古民族师范学校合并组建内蒙古民族高等专科学校。

2009年，内蒙古民族高等专科学校升格为呼和浩特民族学院。

2012年9月，教育部决定由中央民族大学对口支援呼和浩特民族学院。 

2013年，经自治区教育厅学位办审核，学校被批准为新增学士学位授予单位。

2016年，学校通过教育部本科教学工作合格评估。

院系专业

截至2016年11月，学校设有15个教学机构；开设29个本科专业，10个专科专业，其中27个本科专业以蒙汉双语教学为主。