2002年，河南农业大学华豫学院创建。
2005年7月，被教育部批准设立的独立学院。
2004年，学校成立体育学院。
2006年，学校成立文学院，后改为人文学院。同年9月，风景园林学院成立招生。
2010年，被选为中国民办教育协会高等教育专业委员会理事单位。
2011年4月，教育部发函同意河南农业大学华豫学院转设为商丘学院，商丘学院为独立设置的民办普通本科学校。