1984年4月在原广东省农村经营管理干部学校的基础上筹建广东省农业管理干部学院，同时将广东省农业科技干部进修班并入其中。

1985年9月，广东省人民政府批准同意成立广东省农业管理干部学院，并于当年开始招收大专生。

1986年3月，经国家教委备案，正式成为成人高等学校。

1994年12月，学院举行建院10周年校庆，全国政协委员、香港新界乡议局主席刘皇发先生向学院捐资150万元办学，校庆当天举行教学楼、刘皇发图书馆落成庆典。

1999年，经省教育厅同意开始高职专业试点招生，并确定办好高等职业教育是学院今后发展的目标和方向。

2000年9月，学院举行建院15周年校庆。

2006年4月，广东省人民政府批复同意在广东省农业管理干部学院的基础上设立广东科贸职业学院，同年5月在教育部备案，成为高等职业技术学院，隶属省农业厅管理。

2008年7月，广东省人民政府批准学院划转省教育厅管理。

校区专业

白云校区

畜牧兽医

畜牧兽医（宠物医学）

商检技术（食品质量与安全检测）

生物技术及应用（生物制药，酒类的品尝与营销）

食品加工技术（食品加工与营销）

园艺技术（都市园艺）

园林工程（规划设计）

建筑设计与环境艺术

商务英语

商务英语（旅游英语）

商务英语（会展英语）

计算机网络技术

软件技术

计算机应用技术

物业管理

工商企业管理

工商企业管理（行政管理）

工商企业管理（连锁管理）

物流管理

文秘（商务秘书）

天河校区

会计电算化

投资理财

国际商务

电子商务

市场营销

其中园艺技术、畜牧兽医 为省级重点（培育）专业。

学院领导

1、现任党委书记：耿静超 ，男，1961年1月出生，广西北海人；中山大学在职研究生，硕士，高级农经师。

2、原院长：张德扬（2011年8月31日离任）。

3、现任院长：冯定远，男，1961年7月出生，广东阳江市人；农学博士，教授，博士生导师。

4、现任副院长：李映强，男，1954年1月出生，四川南充人；华南农业大学硕士研究生导师。

5、现任纪委书记：李建辉，男，1964年9月出生，广东大埔人；

6、现任副院长：肖智远，男，1961年10月出生，广东省汕头人；农学学士，公共管理硕士，研究员。

7、现任副院长：宋新辉，男，1966年1月出生，广东五华人；硕士学位，2011年11月至今，任该校党委委员，副院长。