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1965年6月16日，创办广东省中药材学校，校址在广州市塞坝口；
1974年3月，迁址至浆栏路并更名为广东省商业技校第一分校；
1979年9月，改为广东省医药技工学校；
1983年，成立广东省医药职工中专学校，与广东省医药技工学校一起办学；
1984年，迁址至广州市天河区龙洞；
1986年3月，成立广东省医药学校；
2002年，经广东省人民政府批准，同意升格为高等职业院校；
2003年5月，经教育部备案，正式升格为广东化工制药职业技术学院；
2007年5月，经教育部备案更名为广东食品药品职业学院；
2008年7月，学院顺利通过教育部高等职业院校人才培养工作评估；
2013年11月，成为广东省示范性高职院校建设项目立项建设单位。
该校有14个教学单位，开办32个专科专业。
| 教学单位 | 专业 |
|---|---|
| 制药工程学院 | 化学制药技术、中药制药技术、药物制剂技术 |
| 药学院 | 药学、药物分析技术、食品药品监督管理、药品经营与管理、卫生信息管理 |
| 中药学院 | 中药、中药鉴定与质量检测技术、中药制药技术 |
| 生物技术学院 | 生物制药技术、生物技术及应用 |
| 食品学院 | 食品营养与检测、功能性食品生产技术、餐饮食品安全 |
| 管理学院 | 市场营销、电子商务、物流管理 |
| 医疗器械学院 | 医疗器械制造与维护、医用电子仪器与维护、医学影像设备管理与维护、医疗电子工程 |
| 化妆品与艺术设计学院 | 化妆品技术与管理、艺术设计、人物形象设计 |
| 中医保健学院 | 健康管理、康复治疗技术 |
| 护理学院 | 护理 |
| 软件示范学院 | 软件外包服务、医用软件与网络技术 |
| 国际交流学院 | 生物制药技术（中外合作办学）、药品经营与管理（中外合作办学）、健康管理 |
| 思想政治理论教学部 | -- |
| 基础部 | -- |
| 继续教育学院 | -- |
| 姓名 | 职位 | 职称 | 备注 |
|---|---|---|---|
| 程辛荣 | 党委书记 | 高级政工师 | 主持学院党委全面工作。分管筹本办公室。负责联系省食品药品职业技术学校、省卫生厅幼儿园。 |
| 郑彦云 | 党委副书记、院长 | 副研究 | 主持学院行政全面工作。分管科研处、创新强校办公室、特色建设办公室、职教集团秘书处。负责联系省中药研究所、职业技能鉴定所。 |
| 索其良 | 党委委员、副院长 | 副主任药师 | 分管学院办公室、继续教育学院、外事办、港澳台事务办公室、思想政治理论课教学部、工会。 |
| 葛虹 | 党委委员、副院长 | 教授 | 分管教务处、电教信息中心、图书馆、实验实训中心、高职教育研究所、教学督导室、示范建设办公室。 |
| 温博栋 | 党委委员、党委副书记兼纪委书记 | 副教授 | 分管党委办公室（政策法规办）、人事处、监察室、学生工作处、团委、招生就业处、保卫处。 |
| 孙师家 | 党委委员，广东省食品药品职业技术学校法人代表、校长（兼党委书记） | 副教授 | —— |
| 马新淼 | 党委委员、副院长 | 主治医师 | 分管财务处、后勤管理处、基建办公室、征地办公室、招标采购办公室。 |
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