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华侨大学于1960年由国家创办，是一所为方便华侨青年回国升学而设的大学，属中华人民共和国华侨事务委员会领导，首任校长由中侨委主任廖承志兼任，学制5年（医学系医疗专业为6年）。
1963年华侨集资兴建陈嘉庚纪念堂，1983年落成。纪念堂矗立在校园中心，成为学校的主建筑。
1960年，华侨大学中文系汉语言文学专业招收学生，暂借福建师范学院上课。
1961年秋，增设数学系应用数学专业和化学系化学专业，借集美华侨补习学校上课。校舍陆续建成后，迁回泉州。
1962年，增设政治系政治教育专业、物理系物理专业、热带作物系热带作物栽培专业。
1963～1965年，先后增设医学系医疗专业、土木建筑系工业与民用建筑专业及农田水利专业、化工系无机物工学专业和基本有机合成专业、外语系印尼语专业、英语专业和日语专业。
至1965年秋，连同设在北京的艺术系，全校共有11个系15个专业，在校学生2300多人，教师480多人，干部职工340多人。至1966年夏，该校共毕业两届学生228人。
华侨大学90%以上的学生来自东南亚等17个国家和地区，以印尼华侨青年为多数。华侨学生热爱祖国，学习勤奋，外语基础较好，文体活动开展活跃。
1966年，华侨大学已建成校舍9万平方米，购置图书30多万册，期刊1.4万多册，其中外文书刊2万多册，建成理、工、医、农等几十个实验室及外语视听教室，还设有印刷厂、自来水厂、小学、幼儿园及其他福利设施。
“文化大革命”期间学校停课，1969年底，被迫停办。多数教师、干部下放劳动，图书、仪器设备被分给其他单位，校舍分配给福建医科大学使用，校产、家具损失殆尽。
1978年4月，国务院批准教育部和国务院侨务办公室报告，决定复办华侨大学。
1978年4月学校复办之初，国家要求华侨大学“面向海外，面向港澳”，办成一所以工科为主、理工结合的工科大学，学制暂定四年。以招收海外华侨及港澳同胞和台湾青年学生为主，同时也招收部分内地的学生（归侨、侨眷子女为主）。
复办后的华侨大学，设有土木工程、机械工程、化学化工、计算机科学、电子工程、数学和物理等7个系。并开办专修班和夜大学。
复办不久，在国务院侨务办公室的领导下学校开始筹备设立华侨大学董事会，1980年元月，华侨大学董事会正式成立并召开第一届一次会议。
1980年开始，华侨大学对招收华侨、港澳台学生，采取单独命题，提前考试和录取的办法。华侨大学是国家学位委员会授权可以授予本科毕业生学士学位的首批高等学校之一。
1981年底，国家学位委员会正式授予华侨大学硕士学位授予权。从次年起，土木建筑、机械工程、电子工程、数学四个系，陆续招收建筑结构、精密机械，应用电子、基础数学等专业的硕士研究生。
1983年被中国政府确定为国家重点建设（扶持）大学，作为“教育战线的重点项目”进行投资。
根据中共中央、国务院《关于进一步办好暨南大学和华侨大学的意见》，学校将办学宗旨调整为“面向海外港澳，面向经济特区”，由理工结合的工科大学逐步转向，办成具有特色的、适应海外及特区需要的综合性大学，并大幅度地调整专业设置 。
1983年后，增设建筑系、中国文化系、外语系、旅游系和艺术系等 。
1984年9月，经国务院侨办批准，华侨大学正式成立了工商管理系，这是中国高校中最早以“工商管理”命名的科系。
1996年7月通过全国建筑学专业评估，准许授予建筑学学士学位，当时国内仅有14所高校通过此评估。学校同时成为教育部最早批准成立的全国八所旅游高等院校之一，成为中国旅游名校T10联盟成员之一。
2002年11月，国务院侨办与厦门市政府签订共建华侨大学厦门校区协议。
2004年1月3日，厦门校区一期568亩土地铁丝网围栏开工。2004年11月7日，占地面积2000亩的厦门校区工程正式动工，华侨大学厦门校区综合教学楼、郑年锦图书馆、王源兴国际会议中心等三项工程举行了奠基典礼 。
2006年10月，厦门校区一期主体建设工程宣告竣工，并于10月16日举办正式启用仪式和校区开学典礼 。
2010年7月1日，国务院侨务办公室与泉州市政府签署第四轮共建华侨大学协议。
2011年1月22日，国务院侨务办公室与厦门市政府签署共建华侨大学协议。
2011年2月25日，国务院侨务办公室与福建省政府签署第四轮共建华侨大学协议。
2016年3月11日，国务院侨务办公室与福建省政府签署新一轮（第五轮）共建华侨大学协议，将华侨大学纳入福建省高水平大学建设行列。今后五年，国侨办至少安排8亿元人民币、福建安排4亿元人民币，支持华侨大学建设发展。
同日、国务院侨办还分别和泉州市、厦门市签署共建华侨大学协议。今后五年，泉州和厦门分别安排1亿元人民币和7500万元人民币，用于支持华侨大学建设。
2017年3月，教育部批准华侨大学设立临床医学本科专业。
2017年4月21日，华侨大学举行医学院揭牌仪式。
2017年5月，学校正式获批成为中国政府奖学金资格院校。
2006-2010年，学校承担国家级科研项目51项，包括国家杰出青年基金、973和863项目；省部级科研项目 329项，其中重大项目6项，重点项目60项。申请各种专利84项；获省部级科学技术奖 12项，其中一等奖2项，二等奖5项；省部级优秀社科成果25项，其中一等奖1项，二等奖10项。
学校教师发表学术论文4128篇。学校在《SCIE》、《EI》上发表的科技论文数量曾居全国高校排名第90位和第55位。2012年共在SCIE、EI、cpcis（istp）发表论文511篇，其中《SCIE》203篇、《EI》197篇、《cpcis》（istp）109篇 。2000-2013年共获授权专利343项 。
学报期刊
《华侨大学学报》（自然科学版）是华侨大学主办的、面向国内外公开发行的自然科学综合性学术刊物。《学报》创刊于1980年，原主管单位为国务院侨务办公室，2003年起主管单位改为福建省教育厅；原刊期为年刊，1982年改为半年刊，1985年改为季刊，2009年改为双月刊，A4开本。中国标准连续出版物号：CN 35-1079/N；国际标准连续出版物号：ISSN 1000-5013；国内邮发代号：34-41；国外发行代号：NTZ1050 。
《华侨大学学报》（哲社版）是由华侨大学主办的综合性人文社会科学学术期刊。1983年创刊，为季刊，国内外公开发行。主要刊登哲学、法学、经济学、管理学、文学等学科领域的论文。学报在首届、第二届和第三届的全国高等学校社科学报评优活动中蝉联“全国百强社科学报”称号，1999年入选《中国人文社会科学核心期刊》（中国社会科学院）。1999年12月入选《中国学术期刊综合评价数据库》来源全文收录期刊和《中国人文社会科学引文数据库》来源期刊。2001年12月在《中国学术期刊 （光盘版） 检索与评价数据规范》执行评优活动中荣获《CAJ-CD规范》执行优秀奖，2003年8月被确定为《中国人文社会科学学报核心期刊》 。
馆藏资源
据2014年图书馆官网显示，华侨大学图书馆共有馆藏150万册、中外现刊3000多种、中外文数据库资源30多个。
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