1910年（清宣统二年），学校在私立淮西中等学堂旧址（今汝南县城关）创建，校名为汝宁府中等实业学堂，是河南省清末兴办较早的6所实业学堂之一。

1911年，改称汝宁府官立甲种农业学校。

1938-1945年，抗日战争期间，学校先后迁至南阳镇平县、邓县、驻马店正阳县莲花寺等地。

其中，于1939年、1945年两次迁回汝南。

1951年，学校更名为汝南农林中等技术学校。

1953年，更名为信阳农业学校。

1956年，学校迁至信阳市。

1958年，更名为信阳农业专科学校，内设专科和中专两部。

1977年，更名为信阳农学院。

1978年，更名为信阳农业学校（大专班）。

1984年，更名为豫南农业专科学校。

1992年，更名为信阳农业高等专科学校。

2004年，新建羊山校区。

2008年，信阳林业学校并入，成立南湾校区。

2011年，南湾校区迁入羊山校区。

2012年，浉河校区迁入羊山校区。

2013年4月，根据《高等教育法》、《普通高等学校设置暂行条例》和《普通本科学校设置暂行规定》的有关规定及全国高等学校设置评议委员会六届二次会议的评议结果，同意在信阳农业高等专科学校基础上建立信阳农林学院，同时撤销信阳农业高等专科学校的建制。

科研成果
科研项目

据2014年学校官网显示，信阳农林学院有10项成果获河南省科技进步二等奖，在水稻、油菜品种改良，信阳毛尖品质升级，淮南猪品种选育，固始"笨蛋"增产增收，华英鸭、南湾鱼技术服务，生态鳖、高产虾科技攻关等方面成绩卓著、贡献卓越。教师1990年来公开发表学术论文2240篇，出版学术著作、教材330部，承担省部级以上科研项目219项，获得省部级奖84项，获国家专利16项;主持起草制定《地理标志产品-信阳毛尖茶》国家标准(GB/T22737-2008)于2008年颁行，实现信阳市制定国家标准"零"的突破。2011年该学院获河南省农业科技工作先进单位称号，《信阳农专学报》多次被评为"河南省一级期刊"。

2011年来还主动参与信阳"华英富民工程"，承担河南省"科普及适用技术传播工程"项目113项，推广杂交稻栽培技术、畜禽疫病防控技术、茶叶无公害生产技术等农业科研成果70项。