办学历史
1958年，牡丹江医学院创立。

1997年，学校一次性通过原国家教委合格评估。

2006年，学校在国家本科教学水平评估中被专家组给予了优秀的评价。

2009年，学校经国务院学位委员会批准为新增硕士学位立项建设单位。

2013年，学校通过硕士学位立项建设单位整体验收。

2014年，学校开始招收基础医学、生物医学、临床医学硕士研究生。

办学条件
院系专业
2014年官网显示，学校有基础医学院、临床医学院、医学影像学院、药学院、公共卫生学院、护理学院、卫生管理学院、成人教育学院、外语教学部、口腔医学院、体育教学部等11个院(部)。[2]开设临床医学、医学影像学、麻醉学、医学检验学、护理学、康复治疗学、口腔医学、药学、制药工程、药物制剂、预防医学、信息管理与信息系统、公共事业管理、应用心理学、市场营销、医学影像技术、生物医学工程等17个本科专业。

师资力量
2014年学院官网显示，学校有教职工2600人，具有副高级以上职称600多人。专任教师580多人，具有博士学历88人(其中留学归国博士7人)，硕士学历550人。有省级教学名师2人，省级教学团队2个，博士生导师5人，硕士生导师120人，全省卫生系统有突出贡献中青年专家17人，牡丹江市优秀中青年专家8人。聘请美国著名医学专家葛仁山教授来校工作，聘任共享院士2人、客座教授19人。

省级教学团队:牡丹江医学院内科学教研室教学团队、机能学实验教学团队

共享院士:孔祥复、付小兵

学科建设
2014年学院官网显示，学院有6个省级重点学科 。3个一级学科硕士授权点。

黑龙江省级重点一级学科:基础医学、生物学、药学

黑龙江省级重点二级学科:内科学、影像医学与核医学、外科学

黑龙江省一级学科硕士授权点:基础医学、生物学、临床医学

教学建设
截至2013年，学院有国家级一类特色建设专业1个、省级一类特色专业1个、省级重点专业4个，省级教学示范中心3个，省级人才培养模式创新实验建设项目1个，省级精品课程6门。

国家级一类特色建设专业:医学影像学

省级一类特色专业:医学影像学

省级重点专业:医学影像学、临床医学、麻醉学、医学检验

省级教学示范中心:临床技能训练中心、基础医学实验中心、药学实验教学中心

省级人才培养模式创新实验建设项目:医学影像学医工结合人才培养模式

省级精品课程:系统解剖学、组织学与胚胎学、医学遗传学、病原生物学、医学影像设备学、诊断学

交流合作
截至2013年，学院和俄罗斯海参崴国立医科大学、吉尔吉斯斯坦医科大学、韩国首尔大学医学院、韩国仁川医科大学以及日本金泽医科大学及菲律宾法蒂玛大学等建立了交流与合作关系。