学校起源有两支。

其一是1937年创立的蒲圻简易师范学校和1942年创立的湖北省立第一高级中学，几经变迁，于1971年合并组建湖北省咸宁地区师范学校；1977年升格为武汉师范学院咸宁分院；1983年更名为咸宁师范专科学校；1993年更名为咸宁师范高等专科学校。

其二是1965年创立的湖北医学院咸宁分院，1994年独立设置咸宁医学院。2002年3月，咸宁医学院、咸宁师范高等专科学校合并组建咸宁学院；2011年12月，更名为湖北科技学院。学校在长期发展历程中，从单一性的师范教育和医学教育，几经艰苦创业、升格合并、交叉融合，逐步发展为一所综合性本科院校。1977年开始招收本科生，1995年以来，相继与武汉大学、华中科技大学、华中师范大学、湖北大学、武汉纺织大学、湖北医药学院等高校联合培养博士、硕士研究生。2011年，药学获批专业硕士学位授予权，2012年招录首届研究生。

截至2018年，学校现有教职工共1398人，其中专任教师1023人，正高职称120人，博士257人，兼职博士生导师、硕士生导师87人；有特聘院士2人、教育部新世纪优秀人才2人、湖北省“百人计划”人才2人、“楚天学者”15人、“彩虹学者”24人、“揽月学者”22人。享受国务院政府津贴和省政府专项津贴专家与湖北省有突出贡献中青年专家20余人、全国优秀教师3人。有省级重点产业化团队1个（非动力核技术产业化创新团队）；省级教学团队2个（药理学教学团队、地理科学教学团队）。