湖南国医专科学校时期

1933年冬，湖南中医药界名流吴汉仙、张牧庵、易南坡、刘岳仑、王纾青、郑守谦、郭厚坤、黄菊翘等人发起创办湖南国医专科学校。

1934年春，湖南国医专科学校正式成立，吴汉仙担任校长，易南坡任董事长兼顾问，时任湖南省政府主席何健任名誉校长。             湖南省中医进修学校时期

1952年冬，湖南省卫生厅派唐构宇等筹建湖南省中医进修学校。

1953年9月30日和10月7日，分别经中南行政委员会卫生局和中央人民政府卫生部批准正式成立。

湖南中医学院时期

1958年底，湖南省委、湖南省人民委员会决定在湖南省中医进修学校的基础上创办湖南中医学院，筹建者为崔洪源、谭日强等。

1960年11月1日，湖南中医学院成立大会召开，随后确定这一天为校庆日。

1986年，中共湖南中医学院第三届党员代表大会讨论确定校训:文明 求实 继承 创新。

1990年，原湖南科技大学成建制并入。

2002年，湖南中医学院与湖南省中医药研究院合并，实行校院合一的管理体制。

湖南中医药大学时期

2006年2月14日，经国家教育部批准更名为湖南中医药大学。

2006年11月26日，正式挂牌更名。

2012年2月22日，经湖南省普通高等学校招生委员会第一次全体会议批准，湖南中医药大学自2012年起调整至本科一批录取。

2015年，入选“卓越医生（中医）教育培养计划”。

教学建设

截至2013年，该校拥有医学基础、临床技能、药学基础、药学技能和综合信息5大教学实验中心。教学、科研仪器设备总值1.2亿元，40万元以上的贵重仪器设备11台件。其中国家级实践教学示范中心1个，省级实践教学示范中心3个。各类教学实验室能开出实验项目570个。

国家级实践教学示范中心

中医机能实验室教学中心

省级实践教学示范中心

医学基础实验中心、药学技能教学实验中心、中医诊断教学实验室

学科建设
截至2018年5月，现有博士后科研流动站2个，一级学科博士学位授权点3个，二级学科博士学位授权点23个，博士专业学位授权点1个；一级学科硕士学位授权点7个，二级学科硕士学位授权点42个，硕士专业学位授权点7个。建有国家重点学科1个，国家中医药管理局重点学科23个，湖南省重点学科10个，其中湖南省优势特色重点学科2个，构建了以中医药学科为主体的三级重点学科体系。中医诊断学在本学科研究领域居国内领先水平。