1976年，创建了计算机科学系。

1977年11月，建立了理论化学研究所；

1977年，吉林大学开始招收四年制本科学生。正式恢复全国统一考试的招生制度。

1978年3月20日举行了本科新生开学典礼，10月15日研究生开学。

1978年，吉林大学被重新确定为教育部直属国家重点综合性大学。

1978年4月，胡绍祖来吉林大学任党委书记，7月，唐敖庆被任命为校长。

1980年1月，吴式枢教授被评为中国科学院学部委员。

1981年，成立人口所。

1983年4月，成立古籍整理研究所。

1983年9月，建立政治学系，是中国高等院校中第一个恢复、建立的政治学系。

1984年2月，中央批准吉林大学组成新的领导班子，温希凡任党委书记，唐敖庆任校长。

1984年8月，国务院批准，中华人民共和国22所重点大学首批试办研究院，10月13日吉林大学研究生院成立。

1984年8月，成立分子生物学系。

1984年10月19日至22日，召开第八次党员代表大会，温希凡任党委书记。

1985年9月1日，经国家教委党组批准，吉林大学开始试行校长负责制。10月建立校务委员会，唐敖庆任主任。

1985年10月12日，吉林大学举行首批博士学位授予大会，授予10位研究生博士学位。

1986年1月，国家教委任命唐敖庆为吉林大学名誉校长，任命伍卓群为校长。

1986年10月，召开建校40周年庆祝大会。党和国家领导人彭真、李鹏、方毅、胡乔木为学校建校40周年题词。

1986年，吉林大学决定在双德乡建设南校区。

1988年3月，召开第九次党员代表大会，选举胡德宝任党委书记。

1988年7月，吉林大学举行南校区建设工程开工仪式暨逸夫图书馆奠基典礼。

1989年10月，樊万清调任吉林大学党委书记。

1992年1月，孙家钟教授、江元生教授、徐如人教授、沈家骢教授当选中国科学院学部委员。

1993年4月，吉林大学召开第十次党员代表大会。刘中树任党委书记。

1995年7月，高鼎三教授当选中国工程院院士。

1995年9月，国家教委和吉林省人民政府共同组织了对吉林大学申请进入“211工程”的部门预审，专家一致建议通过吉林大学“211工程”部门预审。

1996年2月，国家教委任命刘中树为校长、王文金为党委书记。

1996年3月28日，国家教委批准正式建立吉林大学研究生院。

1996年9月21日、22日，以“振奋精神、凝聚力量、继往开来、再创辉煌”为主题，举行了建校50周年庆祝和纪念活动，党和国家领导人江泽民、李鹏、李瑞环、李岚清、荣毅仁、费孝通、宋健等为吉林大学建校50周年题了词。

1997年9月1日，国家教委党组下发《关于吉林大学实行党委领导下的校长负责制的通知》。

1997年9月2日至5日，召开中国共产党吉林大学第十一次代表大会。党委书记王文金代表上届党委作了题为《求实创新，励志图强，为建设社会主义大学而奋斗》的工作报告。报告强调，学校由1985年9月开始试行的校长负责制，改为党委领导下的校长负责制，是学校领导体制上的重要转变，对加强和改善新形势下党委对学校工作的统一领导提出了更高的要求。

1998年，中华人民共和国全面推进以“共建、调整、合作、合并”为方针的高等教育管理体制改革。

2000年6月12日，根据国务院关于高教管理体制改革和局部结构调整的决定，经教育部批准，原吉林大学与吉林工业大学、白求恩医科大学、长春科技大学、长春邮电学院合并组建新的吉林大学。合并之后，由于规模庞大，又分布在长春各处，有“美丽的长春市坐落在吉林大学校园当中”的美称。

2002年1月13日，珠海市与吉林大学签订《珠海市人民政府、吉林大学合作建设吉林大学珠海校区协议书》，建立吉林大学珠海校区。

2004年5月20日，根据中华人民共和国教育部《教育部关于同意吉林大学与珠海兴国教育投资有限公司东荣大厦合作试办吉林大学珠海学院的批复》，试办吉林大学珠海学院。吉林大学珠海学院为独立学院。

2004年8月29日，中国人民解放军军需大学番号撤销。吉林大学与中国人民解放军军需大学合并，中国人民解放军军需大学更名为吉林大学和平分校，相对独立办学，具有独立法人资格。

2005年1月7日，根据《关于军需大学并入吉林大学后管理模式的若干意见》，明确了“军需大学并入吉林大学后，成为吉林大学的一个校区（和平校区），改称农学部。学校对学部实行统一领导和管理，按学校授权，学部相对独立管理校区事务”。军需大学军校时代正式结束。

2006年9月，举行了合校六周年暨建校六十周年校庆。

2007年3月19日，吉林大学财务处在校内网站公布《关于召开征集解决学校财务困难建议座谈会的通知》（校财字[2007]9号）。通知中表示，从2005年起，每年贷款利息支出1.5亿至1.7亿元，大学财务出现困难，“向广大师生征集具有建设性、操作性强的合理化建议”。

2007年12月11日 吉林省人大常委会第三十九次会议通过任命吉林大学党委书记张文显为吉林省高级人民法院副院长、审判委员会委员。

2008年1月13日 吉林省第十一届人民代表大会第一次会议闭幕，吉林大学党委书记张文显当选吉林省高级人民法院院长、党组书记。

2008年3月23日 中组部在全校干部大会会上宣布原兰州大学党委书记陈德文就任该校党委书记，免去张文显党委书记职务。

2008年11月7日 中组部在全校干部大会会上宣布原山东大学校长展涛就任吉林大学校长，免去周其凤吉林大学校长职务，周其凤转调为北京大学校长。

2009年6月11日，吉林大学党委常委会议研究通过了新的《吉林大学学术委员会章程》，并启动了各级吉大教学楼学术委员会换届调整工作。这是吉林大学深入学习实践科学发展观活动的具体成果之一，对探索建立大学民主管理制度有着重要意义。此次新《章程》的出台和新一届学术委员会的调整将带来一种新的理念、新的管理体系和工作模式，还将引领一种新的大学文化与风尚。

2009年6月16日，教育部、国土资源部共建吉林大学地学部协议签字仪式在吉大举行。教育部党组书记、部长周济，国土资源部党组书记、部长、国家土地总督察徐绍史，吉林省省长韩长赋，国土资源部党组成员、副部长、国家测绘局局长徐德明，吉林省副省长陈晓光、王守臣，吉大党委书记陈德文，校长展涛等参加了签字仪式。周济与徐绍史共同签署了《教育部、国土资源部共建吉林大学地学部协议书》。

2009年6月18日，吉大东荣大厦会议中心二楼多功能厅洋溢着喜庆的气氛，新一批哲学社会科学资深教授聘任暨证书颁发仪式在这里隆重举行。校长展涛为新聘哲学社会科学资深教授刘中树、孙正聿、张文显、林沄颁发了证书。

2009年6月24日下午，吉大再度与中国银行吉林省分行牵手，建立双方全面战略合作伙伴关系，共同打造银校合作平台。

2011年2月，校长展涛调任教育部信息中心主任，党委书记陈德文代理校长职务。

2011年9月16日上午，吉林大学召开全校教师干部大会，会上宣读了中共中央关于吉林大学校长职务任命的决定，任命李元元为吉林大学校长。

2015年4月10日，国务院总理李克强来访吉林大学，视察了化学国家重点实验室和学生就业创业指导与服务中心。称赞吉林大学为国家和区域发展做出的重大贡献，并祝愿吉大未来更美好。

2017年9月，吉林大学入选国家“双一流”（世界一流大学和一流学科）建设高校名单。

师资力量

截至2018年3月，学校有教师6499人，其中教授2121人，博士生指导教师1384人。中国科学院和中国工程院院士10人，双聘院士36人，哲学社会科学资深教授7人，国务院学位委员会学科评议组成员20人，“万人计划”入选者27人，国家级教学名师9人，中央马克思主义理论研究和建设工程项目首席专家5人，国家“973”计划（含重大科学研究计划）项目首席科学家6人，国家有突出贡献的中青年专家15人，国家“百千万人才工程”入选专家32人，教育部“奖励计划”入选者52人，国家杰出青年基金获得者31人，国家优秀青年基金获得者25人，吉林省“长白山学者”人选90人。

学科建设
吉林大学学科门类齐全，涵盖哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、军事学、艺术学等全部13 大学科门类。截至2013年底，学校有一级学科博士学位授权点44个，硕士学位授权点299个，博士学位授权点237个，博士后科研流动站42个；有一级学科国家重点学科4个（覆盖17个二级学科），二级学科国家重点学科15个，国家重点（培育）学科4个。

博士后科研流动站：哲学、理论经济学、应用经济学、法学、政治学、社会学、马克思主义理论、中国语言文学、中国史、考古学、世界史、数学、物理学、化学、地球物理学、地质学、生物学、力学、机械工程、仪器科学与技术、材料科学与工程、动力工程及工程热物理、电子科学与技术、信息与通信工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、水利工程、地质资源与地质工程、交通运输工程、农业工程、环境科学与工程、兽医学、畜牧学、基础医学、临床医学、口腔医学、公共卫生与预防医学、管理科学与工程、工商管理、公共管理、图书情报与档案管理

博士学位授权一级学科：哲学、理论经济学、应用经济学、法学、政治学、社会学、马克思主义理论、中国语言文学、考古学、中国史、世界史、数学、物理学、化学、地球物理学、地质学、生物学、统计学、机械工程、仪器科学与技术、材料科学与工程、动力工程及工程热物理、电子科学与技术、信息与通信工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、水利工程、地质资源与地质工程、交通运输工程、农业工程、环境科学与工程、食品科学与工程、软件工程、畜牧学、兽医学、基础医学、临床医学、口腔医学、公共卫生与预防医学、药学、护理学、管理科学与工程、工商管理、公共管理、图书馆情报与档案管理

硕士学位授权一级学科：哲学、理论经济学、应用经济学、法学、政治学、社会学、马克思主义理论、心理学、体育学、中国语言文学、新闻传播学、考古学、中国史、世界史、数学、物理学、化学、地球物理学、地质学、生物学、统计学、机械工程、光学工程、仪器科学与技术、材料科学与工程、动力工程及工程热物理、电子科学与技术、控制科学与工程、计算机科学与技术、土木工程、水利工程、测绘科学与技术、地质资源与地质工程、纺织科学与工程、交通运输工程、农业工程、环境科学与工程、生物医学工程、食品科学与工程、软件工程、作物学、农业资源利用、植物保护、畜牧学、兽医学、基础医学、临床医学、口腔医学、公共卫生与预防医学、药学、护理学、管理科学与工程、工商管理、农林经济管理、公共管理、图书馆情报与档案管理、音乐与舞蹈、美术学、设计学