历史沿革
1953年4月，学院前身江苏省交通干部职工培训班创建，设置安品街、建邺路、九儿巷三个分部。

1955年3月，在办学地点不变的情况下，合并三个训练班，创办"江苏省交通干部职工学校"。

1956年1月，学校定名为"江苏省交通干部学校"，总部设在建邺路26号。

1964年，江苏省交通厅等联合发文，决定成立南京汽车职业学校。

1965年，江苏省交通厅整合江苏省南京汽车职业学校、江苏省南京航运职业学校，定名为"江苏省南京交通学校"，校址设在建邺路省委党校内。

1966年学校迁址南京市浦口沿江乡冯垟江苏省金陵汽车配件厂内，同年，位于镇江谏壁的江苏省汽车学校迁入。

1969年12月，学校停办。

1973年11月，经省革委会发文批准，学校复办，校址设在南京农业机械化学校内。

1996年，学院开始试办高职班。

2001年6月，学校成为江苏省政府批准的首批独立升格的高等职业技术学院。

2002年11月，省发展计划委员会同意学院在南京江宁大学城征地800亩进行新校区建设。

2005年10月，学院搬迁至江宁江宁新校区。

2005年12月，学院接受教育部高职高专人才培养工作水平评估。

2011年4月，学院的第一个省级工程研发中心"江苏省道路交通节能减排工程技术研究开发中心"成立。

2012年7月，学院与南京林业大学于在南京签署了《南京交通职业技术学院-南京林业大学高职与普通本科分段培养项目合作协议》，决定"交通运输"和"物流管理"两个专业实施"3+2"分段培养，联合培养本科层次高端技能型人才。

办学条件
师资力量
截至2015年1月，学院有教职工616人，专任教师404人，教授、副教授等高级职称198人，博士、硕士学位教职工346人；有交通运输部高职教育专业带头人3名，江苏省"六大人才高峰"2名，"333工程"第三批次培养对象1名，江苏省高校"青蓝工程"中青年学术带头人3名、优秀青年骨干教师12名，江苏交通"100人才工程"7名，江苏省高等学校教学名师1名，江苏省交通系统教学名师8名；省级优秀教学团队1个。

江苏省高等学校教学名师：杨益明

江苏交通"100人才工程"：张永春，杨益明，盛海洋，和玉宏，蒋玲等

江苏省级优秀教学团队：汽车运用技术教学团队(文爱明)

院系设置
截至2015年1月，学院有汽车工程学院、路桥与港航工程学院、运输管理学院、电子信息工程学院、机电工程学院、建筑工程学院、人文艺术系六院一系和思想政治理论课教研部、基础教学部、体育教研部以及继续教育学院三部一院，开设本科专业8个，专科专业39个。