历史渊源
南京科技职业学院的发展史，同我国的现代化历程和工业化进程有着深刻渊源。在20世纪初叶，著名爱国民族资本家范旭东等人在南京长江北岸六合县的卸甲甸（现为六合区大厂镇），举办硫酸铵厂。1937年2月投产成功，生产出了第一批硫酸铵，成为当时具有世界先进水平的联合企业。后因该厂拒绝与日本侵略者“合作”，在投产仅九个月后毁于战火。范旭东逝世后，侯德榜继任总经理，设法恢复工厂生产。1952年，永利公司改为公私合营后，陆续输送了大量科技人员到全国化工、轻工、核能、机械等部门工作，在生产建设中发挥了技术骨干作用。1958年，南京化学工业公司为了保障企业生产，承担培训和支援建设任务，建立了永利化专，由南化公司代管，由此揭开了学院发展的序幕。

艰苦创业
20世纪50年代中后期，在我国全面建设社会主义的热潮中，为支援全国各地的技术力量，保证自身生产和发展需要，南京化学工业公司工厂党委决定成立一所专业学校。1958年8月永利化工专科学校正式诞生，当年学校参加全国高校统一招生，录取了一百名统招考生。1959年5月，南化公司在磷肥厂教育科、永利宁厂教育科和所属工厂学校的基础上，成立南化公司化工学院。学院列入国家批准的高等学校名单，成立了相关专业的系部和教研组。学院开设了全国仅有的添加剂专业，重视课堂教学，建立了完善的规章制度。1962年秋，化工部决定撤销南化公司化工学院，12月，技工学校迁入化工学院新校址。1965年上半年，化工部决定南化技校并入南京动力学校，校名改为化工部南京动力分校。

曲折发展
1966年3月，南京动力分校从南京动力学校分立出来，改名为化工部南京化工职业技术学院 学院景色(12张)南京化工学校。学校开展半工半读试点工作。1966年6月6日，化校全面停课。1968年，学校转化为南京化肥厂厂办校，更名为南京化肥厂化工学校。学校在经调查研究，寻找到了一条为工厂培训新工人的办学思路。学校举办了省内的氮肥厂干部轮训班和全国性的冶金部烟气制酸训练班。1973化校恢复招生和上课。学校重归南化公司领导，校名改为南化公司技工学校。根据1974年7月4南化公司技工学校更名为南化公司化工学校。秋季，学校招收新生110名，编入化机、无机专业学习，共四个班，学制三年。1975年至1978年，南化公司工人大学与化校联署办公。1976年秋，学校开设了石油化工专业，标志着化校的化工专业已从无机逐步向有机转变。

改革发展
1977年5月，江苏省委决定，在化工学校的基础上，成立南京化工学院南化分院。学校设立了四年制本科化南京化工职业技术学院图书馆详情(9张)机、有机、无机、仪表四个专业。化机专业是全国化工中专的牵头专业，化机专业教材编审委员会负责学校。1983年5月，经省石油化学工业厅批准，南化公司化工学校更名为南京化工学校1987年11月，南化公司批准我校正式实行校长负责制。1988年11月，化工部教育司委派化工中专教育质量评估小组对我校进行评估检查。评估组认为，南京化工学校是全国化工系统中专中办学条件较好、师资力量较为雄厚的一所老校，在全国化工中专中有一定影响，取得了优秀的成绩。

稳健发展
1993年7月，学校被省政府批准为省（部）级重点中专。学校积南京化工职业技术学院军训(12张)极进行了以调整专业结构，更新专业内容为重点的教学改革。化工科将炼制专业改为有机专业，无机专业改为化工工艺，并与南京化工学院联合开办了大专函授班。基础课科开设了营销新专业；工自科与南京动力专科学校联合开办大专函授班，将化工仪表及自动化专业改为工业仪表及自动化专业；并增开了微机应用与办公室自动化班。学校本部学生增加到1618人，校外办学点增加到12个班。1994年8月，经国家教委批准成为国家级重点中专。1997年，机械厂研究发明的多功能回转窑（复肥设备）获专利。1998年3月26日，南化集团公司和省石化厅领导正式签署《交接协议》，学校由此划归省石化厅直接管理。2000年5月31日，经教育部批准顺利通过省教育厅评估，成为首批国家级重点中等职业学校。

跨越发展
50年校庆照片1996年，在教育部的支持下，江苏逐步扩大优质中专校升格为高职学院的试点。学校紧抓机遇，加快发展，积极发展高等职业教育，先后开设了5年制、4+2学制（挂靠东南大学）及3+3学制（挂靠南京工业大学）高职班。在册生人数增加到4335名，其中高职学生1050名。2001年6月19日，经江苏省人民政府批准，南京化工学校升格为南京化工职业技术学院，成为江苏省教育厅直管的一所普通高校。学院升格后，原地扩建，新征土地33.93万平方米进行新校区建设。2005年底，学院顺利通过了教育部组织的高职高专院校人才培养工作水平评估初评，并取得“优秀”成绩。2006年确立了争创示范性高职院的目标。6月被确定为江苏省示范性高职院建设单位。2006年10月23--24日，在江苏省教育厅的指导下，由南京化工职业技术学院牵头成立了江苏化工职教集团（Jiangsu Chemical Industry Vocational Education Group;缩写成：JSCVEG），学院成为集团理事长单位。2007年4月1日起，学院开始实施二级管理体制。学院的工作重点将进一步转向宏观层面，系（部）是学院实施教育教学、科研与管理的基本单位,是在学院宏观调控下依法治教、相对独立的办学实体。2008年2月基层党建考核工作成绩为优秀评级。