历史沿革
南京中医药大学始建于1954年，历经江苏省中医进修学校、江苏省中医学校、南京中医学院、江苏新医学院、南京中医学院（恢复建制）等历史时期，是中国建校最早的高等中医药院校之一，1995年更名为南京中医药大学，2002年开辟仙林校区，2010年列为江苏省重点建设高校，2011年成为江苏省人民政府和国家中医药管理局共建高校。

办学条件
学科建设
截止2014年6月，学校建有3个国家重点学科、2个国家重点（培育）学科、4个江苏省高校优势学科建设工程、14个国家中医药管理局“十一五”重点学科、19个国家中医药管理局“十二五”重点学科、8个江苏省重点学科。拥有中医学、中药学、中西医结合3个博士后科研流动站，25个博士点（一级学科博士学位点3个 、二级学科博士学位点22个）和44个硕士点（一级学科硕士学位点5个、二级学科硕士学位点39个），博士点覆盖中医、中药、中西医结合所有二级学科，具有博士生导师自审权和主干学科专业的教授评审权。学校还是国务院学位办、教育部、卫生部、国家中医药管理局授予的临床医学博士、硕士专业学位试点单位，具有在职人员申请硕士学位的授予权。

一级学科博士学位点（3个）：中医学、中西医结合、中药学

一级学科硕士学位点（5个）：中医学、中西医结合、中药学、药学、护理学

二级学科博士学位点（31个含17个自主设置学科）：中医学（17个含5个自主设置学科）、中西医结合（6个含4个自主设置学科）、中药学（8个自主设置学科）

二级学科硕士学位点（42个含10个自主设置学科，另有10个专业可授予专业学位）：中医学（18个含6个自主设置学科）另有7个专业可授予专业硕士、中西医结合（7个含5个自主设置学科）另有1个专业可授予专业硕士、中药学（8个自主设置学科,1个专业硕士学位授权点）、药学（6个）、临床医学（2个）另有2个专业可授予专业硕士、公共管理（1个）

国家重点学科（3个）：中药学、中医医史文献、中医儿科学

国家重点（培育）学科（2个）：中医学、中医内科学

江苏省高校优势学科建设工程（4个）：中医学、中药学、中西医结合、护理学

国家中医药管理局“十一五”重点学科（14个）：方剂学、温病学、中医儿科学、中医妇科学、中医肝胆病学、针灸学、药用植物学、中药药理学、中药炮制学、中医医史文献学、中医护理学、中医脾胃病学、中医肾病学、中医肛肠病学

国家中医药管理局“十二五”重点学科（19个）：伤寒学、中医诊断学、临床中药学、中西医结合基础 、中医痹病学、中医肿瘤学、中医骨伤科学、中医耳鼻喉科学、中医养生学、推拿学、中药药剂学、中药化学、中药资源化学、中医药信息学、中医文化学、中医药管理学、中医皮肤病学、中西医结合临床、中医心病学

江苏省重点学科（8个）：中医临床基础、方剂学、中医诊断学、中医内科学、中医外科、中医妇科、针灸推拿学

教学建设
截止2014年6月，学校拥有15个本科专业，30余个专业方向，涵盖医、管、理、工、经、文等多个学科门类，初步形成了以中医药为主体，多学科相互渗透、优势互补、协调发展的办学格局。学校建有5个国家级特色专业、6门国家级精品课程、2个国家级教学团队、1个国家级人才培养模式创新实验区、2个国家级实验教学示范中心、25部国家级规划教材（主编）。学校建成22所附属医院、5所中西医结合临床医学院，各类教学及毕业实习基地逾百所。是国家教育部确定的国家基础学科理科人才培养与科学研究基地（试办）、首批获准接受和培养留学生及台湾地区学生的中医药高等院校之一、全国中医师资进修教育基地。

国家级特色专业（5个）：中医学、中药学、针灸推拿学、中药资源与开发、护理学

国家级实验教学示范中心（2个）：护理实验教学中心 、中医临床实验教学示范中心

国家级精品课程（6门）：温病学、中医儿科学、中医内科护理学、中药炮制学、中医诊断学等

国家级人才培养模式创新实验区（1个）："精诚计划"中医人才培养模式实验区

国家级教学团队（2个）：中医儿科学教学团队、中医内科学教学团队