历史沿革
喀什大学的前身是喀什师范学院，1962年上半年，自治区党委和人民政府对自治区大专院校进行调整，决定将原新疆师范学院和新疆大学合并，从中抽调部分教职员工、图书资料和仪器设备，在喀什市组建新疆喀什师范专科学校。

1978年8月，经国家教育部批准，学校升格为本科院校，更名为喀什师范学院开始承担硕士研究生培养任务。

2003年6月，经国务院学位委员会审核，学院获得硕士学位授权单位资格，开始承担硕士研究生培养任务。从建校到1979年底的17年间，学院是新疆5所高等院校中唯一的一所高等师范院校。

2012年5月，喀什地委办公室、行署办公室联合下发《关于成立喀什大学筹建工作领导小组的通知》，这标志着喀什大学筹建工作

正式启动。

2015年4月29日，教育部同意将喀什师范学院更名为喀什大学。

2015年5月29日，喀什师范学院科学会堂举行喀什大学揭牌仪式，喀什师范学院正式更名为喀什大学。

学术研究
科研平台
据学校官网2015年6月信息显示，大学有2个自治区普通高等学校人文社会科学重点研究基地、2个自治区级重点实验室、1个自治区科技创新团队、自治区工程技术研究中心1个、教育厅普通高校重点实验室3个。

自治区普通高等学校人文社会科学重点研究基地(2个):南疆教育发展研究中心 、南疆经济社会发展中心

自治区级重点实验室(2个):叶尔羌绿洲生态与生物资源研究实验室、新疆特色药食用植物资源化学重点实验室

自治区工程技术研究中心(1个):新疆生物类固废资源化工程技术研究中心

教育厅普通高校重点实验室(3个):南疆口头与非物质文化遗产发展与保护研究中心、南疆基础教育研究中心、南疆经济与社会发展研究中心

自治区科技创新团队(1个):区域生物多样性保护与利用创新团队(王玉涛)

科研成果
2006-2007年，学校教师共发表论文944篇(文科690篇，理科254篇)，其中，在权威、核心级期刊发表论文23篇，在重要级期刊发表论文43篇，出版著作28部，纵向课题立项14项。

2007年，学院教师共发表论文504篇，比2006年增长了18%。其中在权威、核心级期刊发表论文15篇，比2006年增长了87%;在重要级期刊发表论文29篇，比2006年增长了107%;2007年共获得了10项国家级和省部级纵向课题，到校科研经费达23.1万元，课题数量和经费较2006年分别增长了150%和670%。在已获得的国家级课题中，数学系青年教师汪仲文的课题《LHC能区重离子实验数据分析及其网格计算研究》首次获得国家自然科学基金立项;首次获得了全国教育科学"十一五"规划项目和全国社科基金后期资助项目。

2008-2009年，学院教师发表科研成果总数为1041项，其中，论文1027篇，著作14部，发明专利3项。其中，教师发表核心以上成果文科与2006-2007年相比增长336%，理科增长533%，权威级成果发表增长 156%。与2006-2007年相比，学院共申报立项省级以上课题增长100%，外来增长159%。2009年，学院有2名教师获"自治区第十届自然科学优秀学术论文"二等奖和三等奖，2名教师获"自治区第八届哲学社会科学奖"的二等奖和三等奖。

2010-2011年，学院教师发表科研成果总数为1189项，其中，论文1163篇，著作、编著、教材26部。核心级以上论文161篇，与2008-2009年相比，我院教师发表核心以上成果增长36%。共申报立项省级以上课题38项，与2008-2009年相比，增加12项，增长46%;外来经费达到211.5万元，与2008-2009年相比，增加了138.6万元，增长190%。2010-2011年，投入达312万元，比2008-2009年增加182.2万元，增长140.3%。