中国药科大学药学院是中国药科大学组建历史最长的院系之一，可以追溯到1936年成立的国立药学专科学校 ，主要从事与化学药物研究、开发和应用有关的专业教学和科学研究。八十余年中，先后有中国工程院院士彭司勋、药物化学家廖清江、药剂学家刘国杰、药物分析学家安登魁等一批著名的专家、教授在药学院从事教学和科研工作，为学院的发展作出了重大贡献。
2018年10月26日，被教育部遴选为首批“三全育人”综合改革试点院（系）之一。  2018年12月10日，荣获首批全国党建工作标杆院系培育创建单位。 
学院现有1个博士后流动站、5个博士点、7个硕士点和5个本科专业，药物化学、药剂学、药理学和药物分析均为国家重点学科，药物化学和药剂学科多次被评为省级优秀学科梯队。5个本科专业（基础药学理科基地班、药学、药物制剂、药物分析、药物化学），中药学、药物化学和药物制剂专业为国家特色专业。2015年，药学、药物制剂两个专业还入选了江苏高校品牌专业建设工程一期项目。

药物化学(本科)
修业年限：四年                   授予学位：理学学士
 
业务培养目标和要求：本专业学生应掌握药物化学的基础理论、基本知识和实验技能，新药设计和合成路线设计的基本理论和技术，药物生产工艺研究的基本技能和方法；熟悉药品生产质量管理规范、了解绿色化学与环境保护的关系。培养能够从事新药分子设计、先导化合物发现和优化、化学合成和生产工艺等研究的高级科学技术人才。
 
主要课程：大学英语、高等数学、线性代数、数理统计、物理学、无机化学、有机化学、物理化学、分析化学、生物化学与分子生物学、化学生物学、微生物学、天然药物化学、药物合成反应、化工原理、有机光谱分析、药物化学、药理学、药物分析学、药剂学、临床医学基础、药物代谢动力学、药物设计学、计算机辅助药物设计、制药工艺学、专业英语文献等。