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学校始建于1958年，是中国人民解放军总后方勤务部第二预备学校;

1960年，中国人民解放军总后勤部第二预备学校升格为新疆煤矿学院;

1961年，新疆煤矿学院又调整为乌鲁木齐煤矿学校;

1960年，乌鲁木齐煤矿学校升格为新疆煤矿学院;

1962年，新疆煤矿学院调整为乌鲁木齐煤矿学校;

1985年，乌鲁木齐煤矿学校年升格为新疆煤炭专科学校;

1994年，乌鲁木齐煤矿学校更名为新疆工业高等专科学校;

2012年4月，新疆工业高等专科学校升格为新疆工程学院;

2012年9月，新疆机电职业技术学院并入新疆工程学院。