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1995年11月，由万杰集团出资、经山东省人民政府批准，民办山东万杰医学院(筹)创建，同年开始招生，首批开设护理、制药、市场营销三个专业。

1996年，成为高等教育自学考试试点院校。

1998年，成为山东省第一批国家学历文凭试点院校。

1999年3月，经教育部批准成为具有学历教育资格的民办普通高等院校--山东万杰医学高等专科学校，为山东省第一所民办高等院校，同年列入计划内招生。

2000年，中国成人教育协会民办高等教育委员会授予“民办高等教育创业奖”。

2004年7月17日-21日，"山东省解剖学会"2004年学术年会在学校顺利召开。

2008年4月，经教育部批准升格为普通本科高等院校--山东万杰医学院，成为山东省第一所社会力量办学(民办)医药类本科高校。

2008年12月，被山东省人民政府直属大型国有企业山东省商业集团总公司(鲁商集团)接管，学校由私营企业社会力量办学转为国有企业社会力量办学。

2011年，学校财政由山东省财政厅直接管理，学校财政实现省直属。

2013年，学校被团中央授予“大学生服务西部计划优秀等次项目办”称号。

2014年，获批成为山东特色名校工程立项建设单位。

2015年，经教育部批准，同意更名为齐鲁医药学院。